南京清凉寺，始建于南朝，渐兴于唐中和年间，是禅宗一花五叶之一——法眼宗的祖庭。法眼宗为南唐高僧“大法眼禅师”清凉文益所创，其禅学思想在中国佛教史上具有崇高的地位和价值。
为树立寺院形象，与时俱进地弘法利生，清凉寺在2014年启动了寺徽标志（LOGO）的征集工作，得到了广大信众的热情关注和支持。根据理海法师提出的寺徽设计应彰显清凉寺法眼祖庭特色的要求，经对应征集作品件反复讨论和评选，最终评选敲定恽红岗（道一）的设计方案，并由皮艺舟、刘晓薇（道尘）修改完成。
本方案的图形设计整体为圆形，形似眼球，象征法眼宏开，以及法眼宗“理事不二，贵在圆融”的宗风特色；又寓意佛教的究竟圆满，并象征大圆镜智，隐含“举一心为宗，照万法如镜”的禅宗修行精髓。
图形主体部分是篆体的“法眼”“祖庭”，点明南京清凉寺在禅宗一花五叶中的传承，且形似阳刻和阴刻的印章，象征佛教的法印、禅宗的心印；篆书是汉代通用字体，彼时佛法西来，蕴有历久弥新之意。
颜色选用赭黄色及深啡色，象征智慧、大地，也蕴含着福田、厚德、柔和、慈悲等意。
圆环中寺名前后两个对称的圆点，寓意二谛融通、定慧均等；上方的英文寺名则意在表达法眼传续及对外文化交流的开放态度。
感谢三年来所有参与和关注清凉寺寺徽设计工作的朋友们，欢迎对现行方案提出宝贵意见和建议，帮助我们进一步完善和更新。请大家继续关注祖庭建设和发展，广播福田，共生吉祥！
本logo的最终解释权归南京清凉寺所有。
阿弥陀佛！
